分子蒸馏技能应用的领域很广，技能也越加老练。其应用特色有

1.可有效地脱除热敏性物质中的轻分子物质产品物质的脱臭——姜油的脱臭产品物质的脱溶——辣椒红色素脱溶产品物质中脱单体——酚醛树脂中单体酚的脱除

2.脱除产品中的重物质及颜色

精密化学品中常有一些重分子物质、甚至金属离子难以别离，分子蒸馏为此提供了有效办法。乳酸精制，其它如芥酸、亚油酸、亚麻酸、二聚酸、芥酸酰胺、硬脂酸单甘酯、高碳醇的精制及脱色，也需要选用分子蒸馏技能。

3.下降热敏性物质热损伤

鱼油乙酯脱色及浓缩，与传统的釜式蒸馏比较，可明显看出分子蒸馏技能的优势：不只产品得率高，并且产品品质好，绝大多数的天然或合成香精香料都归于热敏性物质，均合适选用分子蒸馏技能提纯。

4.改进传统工艺，进行清洁出产鱼油甘三酯精制，省去了传统工艺中碱炼法脱酸，不但避免了皂化液对环境的污染，变废为宝，并且提高了主产品质量。其它类似产品有小麦胚芽油、米糠油、椰子油、大豆油脱酸等。废润滑油回收，传统工艺除去重杂质的办法为硫酸法，该办法对环境污染很大，而选用分子蒸馏技能则可避免污染，变废为宝。